紐約基因組中心研究人員創(chuàng)建用于單細(xì)胞分析的低成本開源3D打印設(shè)備

lydiazhang   2018-03-02 12:27:37

3D打印的許多優(yōu)點(diǎn)(通常都是這些優(yōu)點(diǎn))使得今天可以在各種行業(yè)中取得創(chuàng)新性進(jìn)展。盡管研究人員和制造商對(duì)操縱3D領(lǐng)域進(jìn)行生物打印,創(chuàng)建實(shí)驗(yàn)室和醫(yī)療設(shè)備等等更感興趣,但醫(yī)學(xué)領(lǐng)域正在取得一些最不可否認(rèn)的重大影響。隨著研究人員不斷深入研究細(xì)胞水平,他們也繼續(xù)在提高全球患者的生活質(zhì)量方面取得更大成功,其中包括使用微流控裝置。

現(xiàn)在,紐約基因組中心(NYGC)和紐約大學(xué)(NYU)的研究人員開發(fā)出了一種更經(jīng)濟(jì),廣泛的單細(xì)胞分析方法,并創(chuàng)建了3D打印的微流控制器。這種便攜式設(shè)備大約相當(dāng)于紙巾盒的大小,已經(jīng)被用于RA研究和治療領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者 - 特殊外科醫(yī)院(HSS)的類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者(RA)的研究。

該研究以及關(guān)于新器械的解釋在最近發(fā)表的一篇論文“使用低成本微流體儀器的類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎滑膜組織的單細(xì)胞RNA-seq”中得到概述。研究人員能夠?qū)⑷?0,387個(gè)單細(xì)胞,導(dǎo)致13個(gè)轉(zhuǎn)錄組不同的簇。

“這個(gè)數(shù)據(jù)集給了我們機(jī)會(huì),以找出可能推動(dòng)RA的進(jìn)展單元的各個(gè)亞群,即使他們沒有被以前的特點(diǎn),說:”拉胡爾Satija博士,一個(gè)核心教員在NYGC,生物學(xué)助理教授在紐約大學(xué),并在該研究的資深作者。

該設(shè)備不僅易于使用,而且是開放源代碼的,可以使用液滴微流體進(jìn)行各種不同的實(shí)驗(yàn)。

“該儀器由固定在3D打印框架上的電子元件和氣動(dòng)元件組成。整個(gè)系統(tǒng)通過在觸摸屏上使用圖形用戶界面的軟件控制進(jìn)行操作。該儀器只需要一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的墻上電源插座,占地面積非常小;小到足以安裝在臺(tái)式或生物防護(hù)罩上“,研究人員在他們的論文中指出。

“構(gòu)建儀器的材料總成本約為575美元。與分別基于研究級(jí)別的注射泵的微流體裝置和商業(yè)微流體平臺(tái)相比,這代表了成本的約20倍和200倍的降低?!?/span>

在研究期間,科學(xué)家們特別著迷于13組中顯示出不同的基因表達(dá)模式。

“手術(shù)切除后大約一小時(shí),來自患者組織的單個(gè)細(xì)胞被標(biāo)記為單細(xì)胞測(cè)序。從這項(xiàng)工作中,我們進(jìn)行了分類無法識(shí)別的成纖維細(xì)胞亞型可能被證明是很重要的藥物靶點(diǎn)我們的RA患者中,”勞拉唐林,在HSS精密醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室助理教授威爾康乃爾醫(yī)學(xué)院的副主任和主要作者說研究。

通過流式細(xì)胞儀,研究小組能夠確認(rèn)這些新組的存在,同時(shí)意識(shí)到它們?cè)赗A患者中表現(xiàn)出與關(guān)節(jié)組織“不同的局部化模式”。

隨著研究人員繼續(xù)致力于為滑膜組織制作全細(xì)胞圖譜,他們還計(jì)劃:

收集其他患有類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的患者的數(shù)據(jù)

探索顯示銀屑病關(guān)節(jié)炎和骨關(guān)節(jié)炎等疾病的樣本

使用專門技術(shù)(CITE-seq)通過評(píng)估表面蛋白來分類細(xì)胞類

檢查樣本,例如那些顯示傳染性疾病的研究,這些研究在標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室中會(huì)更困難

“我們希望這種儀器能夠降低與在基礎(chǔ)研究和臨床環(huán)境中進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)驗(yàn)有關(guān)的障礙,”Stephenson博士說。

NYGC是一家致力于生物醫(yī)學(xué)研究和臨床護(hù)理的非營利學(xué)習(xí)和研究機(jī)構(gòu)。 NYGC制作的作品的目標(biāo)最終是利用基因組研究來創(chuàng)造改進(jìn)的診斷,治療和人類疾病治療。在這里閱讀更多關(guān)于NYGC的信息。

有關(guān)控制器的更多說明可以在這里找到,以及組裝手冊(cè)。研究的作者包括威廉·斯蒂芬森,勞拉T.唐林,安德魯·巴特勒,克里斯蒂娜Rozo,貝爾納黛特蕨菜,阿里Rashidfarrokhi,蘇珊·古德曼,梅西B. Ivashkiv,維維安P. Bykerk,達(dá)納E.橙,羅伯特·B·達(dá)內(nèi)爾,哈羅德·P Swerdlow和Rahul Satija。

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